数据显示，目前建成一座加氢能力大于200公斤的加氢站需要1000多万元，如此高昂的建设成本显然是加氢站快速发展的最大障碍。要想实现加氢站大规模建设，加快产业布局，大幅度降低成本是当务之急。
除了建设成本高昂，加氢站建设还有不少难题，如在技术上存在一定争议，全球范围内也没有统一的标准。我国在质子交换膜组、储氢罐等核心设备的技术储备上还比较薄弱，尚有许多技术难点需要攻关，尤其是在加氢站建设过程中的氢气压缩机、加氢站不锈钢材料、加氢站温度等问题上还存在一定争议。全国氢能标委会主任委员马林聪表示，要尽快组织专家把加氢站方面的标准做起来，推动加氢站的建设。
按照规划，2025年，我国将实现加氢站等配套基础设施的完善。预计2025年后，国内燃料电池汽车产业将进入快速发展阶段，到2030年国内燃料电池汽车年销量规模可达百万辆以上，配套加氢站数量将在4500座以上，对应加氢站投资规模800亿元，相关设备投资规模达到500亿元。目前来看，成本高、技术难度大的难题不解决，加氢站的完善仍存在很多困难，不少业内人士认为，解决这些难题还需要政府主导。
